Desde su creación, la Asociación de Historiadores del Presente ha celebrado varios congresos en los que además se han realizado las Asambleas Generales. El I Congreso se realizó en Segovia con la colaboración del Centro Asociado de la UNED en junio de 2003, titulándose “Cuestiones debatidas”. El II Congreso tuvo lugar en Madrid y Melilla en mayo de 2005 en colaboración con el Departamento de Historia Contemporánea, el CHIDE y el Centro de Asociación de Melilla, denominándose “De la dictadura a la democracia”. Dos años más tarde se celebró en Salamanca y Valderas el III Congreso “El franquismo durante los años cincuenta”, realizándose con el Departamento de Historia Contemporánea de la UNED, la Universidad de Salamanca, el CHIDE y la Fundación 27 de Marzo. El IV Congreso se organizó con el Grupo de Investigación Estudios del Tiempo Presente entre el 2 y el 6 de noviembre de 2009, titulándose “Historia de la Transición: Sociedad y Movimientos Sociales”. El V Congreso tuvo lugar en Madrid a finales del año 2011, centrándose en la Historia de la época socialista (1982-1996) y se coorganizó con la Universidad Autónoma de Madrid y la UNED. El VI Congreso “La apertura internacional de España. Entre el franquismo y la democracia, 1953-1986”, fue organizado en Valladolid en 2014. En mayo de 2017 se celebró junto a la Asociación de Historia Actual, el VII Congreso “La España Actual: Cuarenta años de Historia (1976-2016)”. El VIII Congreso, denominado "Democracia y territorio. 40 años de ayuntamientos y autonomías en España (1979-2019)" se celebró entre el 27 y el 29 de marzo de 2019 en Zaragoza. El IX Congreso Internacional de la Asociación de Historiadores del Presente «El ámbito de lo posible. Crisis y reconstrucción en el último medio siglo (1970-2020)», se celebró en Sevilla entre el 17 y el 19 de febrero de 2022.